我想知道如何在 R 中绘制这些多条引导曲线。
我的代码就像
dat2 <- read.delim("bone.data", sep ="\t", header= TRUE)
y <- dat2[,4]
x <- dat2[,2]
plot(x,y,xlab="age",ylab="BMD",col=ifelse(dat2[,3]=="female","red","blue"))
多条Bootstrap Curves如图8.2左下图所示。
ESL
名为骨矿物质密度的数据可以从这个网站获得:
data
文件的直接链接是: here
请您参考如下方法:
您可以使用 smooth.spline 绘制样条曲线和 lines :
plot.spline = function(x, y, ...) {
s = smooth.spline(x, y, cv=TRUE)
lines(predict(s), ...)
}
所以要执行引导，按照书中的说明，你从数据中随机抽取行替换，然后调用
plot.spline在重新采样的数据上:
bootstrap.curves = function(dat, nboot, ...) {
for (i in 1:nboot) {
subdata = dat[sample(NROW(dat), replace=TRUE), ]
plot.spline(subdata$age, subdata$spnbmd, ...)
}
}
因此，您可以使用此函数为男性和女性运行单独的绘图:
bootstrap.curves(dat2[dat2$gender == "female", ], 10, col="red")
bootstrap.curves(dat2[dat2$gender == "male", ], 10, col="blue")
最终结果:
注意:此代码将产生许多警告(不是错误)，如下所示:
1: In smooth.spline(x, y, cv = TRUE) :
crossvalidation with non-unique 'x' values seems doubtful
这是因为自举重采样。
smooth.spline使用交叉验证来决定给出样条的自由度数，但它不希望重复 x 这样做。值(因为自举重采样总是有效的)。您可以通过选择自己的自由度数来解决这个问题，但这对于此目的来说可能没问题。
